Музей предоставляет информацию по геологическому строению, истории геологического развития и месторождениям полезных ископаемых всех регионов России и стран СНГ, по монографически описанным палеонтологическим коллекциям ведущих отечественных геологов.    
Государственным Эрмитажем передана в музей на постоянное хранение уникальная мозаичная "Карта СССР из цветных камней" площадью 27 кв. м, а также 11 мозаичных гербов союзных республик и герб СССР из цветных камней.